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Also mit meinem Konqueror 3.2.1 kopiere ich ohne Probleme ganze Websites auf meinen Domains, auch mit der Subdomain www davor. Normalerweise reicht auch die IP-Nummer des Server aus. Der Server läuft unter SuSE Linux 9.1, als FTP-Client läuft vsftpd 1.1.3.
Ich nutze zudem beim Nutzer root das Konsolenprogramm sftp.